Fungarium grzybów makroskopowych w swej obecnej postaci powstało w 1988 roku i rozbudowywane było w następnych latach z myślą o udokumentowaniu całości makromikobioty Puszczy Białowieskiej. Z czasem, w wyniku realizacji różnych projektów badawczych i wypraw mikologicznych, sukcesywnie powiększano fungarium o okazy z innych części kraju i zagranicy. Fungarium grzybów makroskopowych obejmuje głównie grzyby zaliczane dawniej do szeroko pojętej grupy grzybów bezblaszkowych Aphyllophorales, inne grupy makrogrzybów reprezentowane są marginalnie. Okazy gromadzone są w formie zielnika. Zasuszone okazy grzybów umieszczone są w strunowych woreczkach w celu zabezpieczenia okazów przed owadami a następnie w składanych kopertach z szarego papieru o wymiarach 14 x 20cm. W prawym górnym rogu koperta jest opieczętowana numerem kolejnym. Każda koperta zawiera również wygenerowaną z programu etykietę zielnikową wraz z kodem QR. Do zbioru w większości przypadków dołączone są również fotografie z szczegółami budowy makro i mikroskopowej grzyba.